慣行農法係指使用一般耕作方式，以化學農藥、肥料以及利用荷爾蒙、抗生素等以增加產品、增進品質的耕作方法。

現代慣行農法則面臨下列幾種之危機：

1.對化學肥料依存度過高，但能源危機已經導致化學肥料之價格高昂及供需量不穩定。

2. 昆蟲或頑草對殺草劑或殺蟲劑之抗藥性日增。

3.土壤有機質及養分過度消耗，導致地力衰退。

4.農藥或肥料污染導致生態環境惡化。

5.農藥或添加物使用過量，影響到人類或動物之食物的安全性。

6.磷礦石資源枯竭。

7.家族經營農場及地域性市場組織逐漸消失等。

說明農藥及殺蟲劑帶來的危害：

1. 毒死蜱→世上最廣泛使用的農藥之一，亦是在農作物中最常見的農藥殘留。長期接觸及急性中毒的病徵相同，包括記憶力和集中力下降、方向感失調、嚴重抑鬱、容易憤怒、思想混亂、頭痛、語言能力下降、反應遲緩、發惡夢、夢遊、渴睡或失眠等，亦會出現如感冒般的症狀，例如頭痛、噁心、虛弱、食慾不振等。

2. 林丹→對環境及人體健康均會造成嚴重影響，可引致血液惡質症和再生障礙性貧血，同時又影響內分泌系統，阻礙正常內分泌系統的生理運作。有研究指出林丹與乳癌有密切的關係。林丹亦可在婦女早期懷孕期間由母體傳至胎兒，引發多種先天性的缺憾。與大部份有機氯種類的農藥一樣，林丹可溶解於脂肪中，並積存在食物鏈中，對多種生物造成影響。

3. 年年春→美國農夫使用於黃豆的除草劑「年年春」，其主要成分是嘉磷塞。嘉磷塞雖對於人體沒有立即危害，但已有許多研究顯示，可能會引起巴金森症、自閉症、失智症、糖尿病、阿茲罕默症等慢性疾病。除了對於人體產生危害之外，因為基改食物而過量使用的除草劑，也對生態有很大影響。

4. 加保扶→加保扶主要經由食入之途徑造成動物的中毒，對禽鳥（尤其是鴨和野鳥）具有極高之毒性。一般認為，由於加保扶粒劑的 大小與形狀，與穀物的種子相似，因此很容易吸引鳥類誤食，而掠食性的鳥類 （如鷹、鷲）則常因食入加保扶中毒死亡的動物屍體而引發中毒。電影「老鷹想飛」裡面提到的農藥就是加保扶，常見於台灣慣行農田。

在慣行田不易看到的蝌蚪、魚等生物；田裡很多小飛蝨，需要瓢蟲、蜘蛛來控制；慣行農法在中出來的作物，那些農藥是水不可能洗得掉的，因為農藥已經完全吸收到植物的全身，吸收到根莖葉的最裡面，難道用清水或鹽水就能輕易沖掉嗎？